闻名遐尔的燕子洞在东北距燕子垭口1000米的半壁上,海拔2343米，北邻水沟垭，由公路上坡约50米即可到洞口，前厅颇宽，约有420平方米，入内即窄渐暗，顿感飞燕掠耳，吱吱有声，约700米不见燕子，却闻滴水如琴，进入3700米，洞体不能容人，只听流水潺潺，却不知洞生何处。

该洞高14米，宽16米，里面栖息着大量短嘴金丝燕。这种燕子身长12厘米左右，虽然数量巨大，但它们飞进飞出时互相却从不相撞，它们一年四季都生活在神农架，当地优厚的自然环境使它们失去了原先南飞北迁的候鸟特征。洞内冬暖夏凉，水流潺潺，洞壁光洁无比，干燥的石壁上挂满燕窝。

洞内冬暖夏凉，空气潮湿，沁水长流，洞壁光洁如玻璃，干燥处挂满燕窝，在燕子垭西北面的岭脊上已修有石阶桥亭，漫步岭上，回首观望，但见金燕风舞，时进时出，高翔低回，敏捷灵巧，如遇雨过天晴，燕群穿阳破雾，剪云裁霞，翱翔冲跌。山势，燕形，云影相映成趣，好一幅生机盎然的景象，这种金丝燕是古老的海洋金丝燕的变种，具有很强的方位变识能力，故是研究地质，考古，鸟禽分类学的好素材。

从燕子垭西北面的石阶桥亭上回首观望洞口，可以看到燕群飞舞，如果是太阳出来的时候，可以看到燕群迎着阳光高翔低回，景象十分壮观。